《药物设计学》是药学专业的专业选修课，是一门数学、物理学、化学、分子生物学、细胞生物学、计算机图形学等相关学科发展而成的以创新新药的研究方法为主要内容的新型的多学科交叉的边缘性学科，本课程以化学生物学为主线，以药物发现为目标，将药物设计学的传统理论和方法与现代前沿科技相结合进行药物设计。内容包括：前药设计、软药和硬药、代谢拮抗原理、生物电子等排原理、受体理论、酶抑制剂、组合化学与高通量筛选、药效团模型、细胞信号转导、生物活性肽、分子杂合原理、化学基因组学原理、类药性、新药开发的基本途径与方法等。通过本课程的教学，使学生了解新药研究和开发的程序，熟悉新药（先导化合物）发现途径，掌握药物设计与发现的理论、方法和技术，了解学科的发展方向，培养创新思维和独立性，成为新药研究和开发的开拓性人才，毕业后能适应21世纪我国新药研究开发的需要。